報(bào)告題目：EigenGWAS：非監(jiān)督的群體基因組選擇位點(diǎn)掃描算法
報(bào)告人：陳國(guó)波，副研究員，臨床研究所、浙江省人民醫(yī)院
報(bào)告時(shí)間：2021年5月14日 15:30——16:30
報(bào)告地點(diǎn)：學(xué)11-304
報(bào)告摘要:
隨著高通量測(cè)序技術(shù)的普及，群體基因組數(shù)據(jù)大量出現(xiàn)，伴隨而來的問題是數(shù)據(jù)缺乏合理分類。利用群體漂變?cè)砗途仃囂卣鞲膶?duì)稱關(guān)系，我們提出了基于群體內(nèi)蘊(yùn)結(jié)構(gòu)的全基因組掃描算法：EigenGWAS。本研究見展示從理論構(gòu)建到算法實(shí)現(xiàn)的整個(gè)過程，以及在一些實(shí)際數(shù)據(jù)分析中的成功實(shí)例。另外，隨著樣本量從最幾年前的幾百例進(jìn)化到幾千、甚至幾十萬例，EigenGWAS從統(tǒng)計(jì)計(jì)算到程序?qū)崿F(xiàn)都面臨一系列挑戰(zhàn)和計(jì)算內(nèi)核的整體提升。
主講人簡(jiǎn)介：
陳國(guó)波，2009年浙江大學(xué)數(shù)量遺傳學(xué)博士，2011~2015年澳大利亞昆士蘭大學(xué)大腦研究所博士后。2017年至今，浙江省人民醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)研究所副研究員。從事統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)研究，在Nature,Lancet,Am J Hum Genet,Hum Mol Genet,Bioinformatics,Mol Ecology等雜志發(fā)表論文40余篇，Google Scholar引用超3200次，H-index 19。
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2021年5月12日
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